中共中国医学科学院药物研究所委员会于2021年10月换届，设置党委委员8名；纪委会设置委员5名。现任党委书记何仲，党委副书记、纪委书记甄宝。

根据《中国共产党普通高等学校基层组织工作条例》、《院校党支部工作实施细则》等有关规定，药物所党委于2025年5月完成支部换届工作，下设33个党支部，其中机关党支部3个、科室党支部13个、企业党支部6个、离退休党支部2个、学生党支部9个。全部支部符合组织设置规范、能够实现堡垒功能