近日,国际顶级化学期刊Journal of the American Chemical Society在线发表了药物所贾美荣团队题为“The One Ring: A Monocycle Producing Class Ⅱ Diterpene Cyclase from Isodon leucophyllus”(一种来自白叶香茶菜的产单环二萜的Ⅱ型二萜合酶)的研究论文。该研究从药用植物白叶香茶菜(Isodon leucophyllus)中发现并鉴定了首个催化香叶基香叶基焦磷酸(GGPP)生成单环产物的Ⅱ型二萜环化酶(DTC),改变了长期以来对DTCs仅产生双环产物的认知。
图. IleuTPS野生型及E366D突变体的产物谱及量子化学计算示意图
半日花烷型二萜是一类结构多样、活性显著的天然产物,其生物合成由DTCs通过质子化启动环化反应,生成双环骨架。迄今为止,已报道的DTCs均产生双环产物,如柯巴基焦磷酸(CPP)。然而,自然界中存在大量单环二萜,其是否可由DTCs直接催化生成一直悬而未决。研究团队从白叶香茶菜中成功鉴定出可催化GGPP生成单环(+)-trixagyl-PP(TPP)的DTC,命名为IleuTPS。研究发现,IleuTPS具有非经典E366IDD催化基序,当E366突变为天冬氨酸(D)后,产物谱发生显著改变,产生了多种双环产物及一个重排单环产物(LPP)。同位素标记实验进一步揭示了两种单环产物的环化机制:TPP通过GGPP折叠成前椅式构象、生成单环后直接去质子化生成;LPP的生成则需经历1,2-氢迁移、1,2-甲基迁移和去质子化。量子化学计算和TerDockin模拟结果表明单环产物并非直接从线性到单环,而是先经双环中间体,再通过去质子化伴随开环形成。
进化分析显示,IleuTPS与产生CPP的柯巴基焦磷酸合酶(CPSs)亲缘最近。将白叶香茶菜中CPS的DXDD基序首个D突变为E后,其产物谱从双环CPP部分转变为单环TPP,提示IleuTPS可能由CPS“新功能化”而来。此外,在同属植物冬凌草(I. rubescens)中鉴定到同源酶IrCPS11,其功能与IleuTPS一致,表明单环DTC可能在香茶菜属中广泛存在。上述研究结果为理解单环二萜的生物合成途径提供了重要依据,为该类结构产物的绿色制备奠定了基础。
药物所研究生梅一婷、周佳丽、谢军、张浩彬和加州大学戴维斯分校的Ian S. Torrence为论文共同第一作者。此外,美国爱荷华州立大学Meimei Xu老师、药物所研究生李靖博、梁苗苗及李静一助理研究员也参与了本项研究工作。贾美荣研究员、Reuben J. Peters教授、Dean J. Tantillo教授及Justin B. Siegel教授为论文共同通讯作者。感谢国家自然科学基金项目(22477142)、中国医学科学院基科费(2021-RC350-003)及协和新星人才专项(2025-I2M-XHXX-082)对本项目的资助。感谢北京大学徐正仁教授、药物所许述研究员和李莉研究员为该工作提供的大力支持和帮助。
论文链接:https://doi.org/10.1021/jacs.6c03321
